Structure du programme (2-468-1-0)

Description de la structure

Version 03 (A13)

La maîtrise comporte 45 crédits. Elle est offerte selon deux cheminements :

- Cheminement avec mémoire (segment 70),

- Cheminement avec stage (segment 71).

Segment 70 Propre au cheminement avec Mémoire

Les crédits du cheminement sont répartis de la façon suivante : 33 crédits obligatoires dont 30 crédits attribués à la recherche et à la rédaction d'un mémoire, de 8 à 12 crédits à option, dont au minimum deux cours de sigle BIN, et de 0 à 4 crédits de cours au choix.

Bloc 70A Obligatoire - 3 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIE 6046 Introduction : éthique de la recherche 1.0
Les développements biomédicaux et l'éthique de la recherche; les grands textes régulateurs; l'analyse d'une problématique éthique; l'évaluation éthique d'un protocole de recherche.
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BIN 60051 Communication scientifique 1.1 0.0 Cours de jour
Présentation orale et écrite par l'étudiant de son projet de recherche ou de stage : la littérature scientifique pertinente, la problématique et les méthodes envisagées. Participation aux séminaires des autres étudiants.
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BIN 60052 Communication scientifique 1.2 2.0 Cours de jour
Présentation orale et écrite par l'étudiant de son projet de recherche ou de stage : la littérature scientifique pertinente, la problématique et les méthodes envisagées. Participation aux séminaires des autres étudiants.
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Bloc 70B Bio-informatique génomique Option - Maximum 12 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BCM 6210 Génomique humaine fonctionnelle 3.0 Cours de jour
Étude du fonctionnement du génome humain. Structure du génome et méthodes d'analyse fonctionnelle, grandes bases de données et outils bioinformatiques. Génomique comparative avec d'autres organismes séquencés. Protéomique et métabolomique.
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BIN 6000 Algorithmes en bio-informatique génomique 4.0 Cours de jour
Comparaison et alignement des séquences biologiques. Structures secondaires des acides ribonucléiques. Recherche de motifs. Assemblage de fragments d'ADN, cartographie physique. Ordre des gènes.
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BIN 6002 Principes d'analyse génomique 3.0
Identification (gènes protéiques et d'ARNs structuraux introns) par comparaison de séquences et recherche de motifs. Alignements multiples et code génétique. Assemblage et annotation de séquence génomique.
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IFT 6299 Sujets en bio-informatique 4.0 Cours de jour  
PGM 6078 Pharmacogénomique 3.0 Cours de jour
Présenter les différentes approches utilisées dans le diagnostic et le traitement de maladies basé sur l'information génomique, avec comme objectif de développer une pharmacothérapie personnalisée optimale.
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Bloc 70C Bio-informatique évolutive Option - Maximum 6 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIO 6245 Analyse phylogénétique 4.0
Théorie et pratique de la systématique : reconstruction, validation et utilisation de phylogénies en biographie, écologie, conservation, et classification. Cours théoriques et travaux pratiques sur ordinateurs.
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MSO 6018 Introduction à l'épidémiologie génétique 3.0 Cours de jour
Introduction à l'épidémiologie génétique et aux méthodes analytiques s'y reliant, appuyée d'exemples relevés de la littérature scientifique et de travaux pratiques portant sur analyses de liaison et d'association génétique.
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Bloc 70D Bio-informatique stat. et apprentissage de machine Option - Maximum 9 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIO 6077 Analyse quantitative des données 4.0 Cours de jour
Apprentissage de méthodes d'analyse quantitative de données biologiques, y compris les données spatiales et temporelles. Travaux pratiques; analyse des données de recherche des étudiants. Remarques: Connaissances requises : biostatistique.
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IFT 6135 Apprentissage de représentations 4.0 Cours de jour
Algorithmes d'apprentissage de représentations des données et réseaux de neurones artificiels profonds. Avantages de l'apprentissage profond pour l'intelligence artificielle. Modélisation de la distribution de probabilité des données.
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IFT 6269 Modèles graphiques probabilistes et apprentissage 4.0 Cours de jour
Représentation des systèmes comme des modèles graphiques probabilistes, inférence dans les modèles graphiques, apprentissage des paramètres à partir de données.
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IFT 6390 Fondements de l'apprentissage machine 4.0 Cours de jour
Éléments de base des algorithmes d'apprentissage statistique et symbolique. Exemples d'applications en forage de données, reconnaissance des formes, régression non linéaire, et données temporelles.
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Bloc 70E Bio-informatique structurale Option - Maximum 12 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BCM 6200 Structure des macromolécules biologiques 3.0
Détermination de structures macromoléculaires par diffraction des rayons-X et par résonance magnétique nucléaire. Modélisation moléculaire. Remarques: Cours conjoint avec l'Université McGill (Biochem 507-604A). Cours offert aux deux ans.
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BIN 6001 Algorithmes en bio-informatique moléculaire 4.0 Cours de jour
Structure 3D des protéines et ARN. Modèles et optimisation de l'énergie potentielle, moléculaire. Espace et recherche de conformations, modélisation comparative et de novo.
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BIN 6003 Architecture des polymères biologiques 3.0 Cours de jour
Conformation macromoléculaire. Analyse de structures tridimensionnelles.
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CHM 6330 Chimie bio-organique 3.0
Importance de la chiralité dans la vie. Facteurs responsables de la spécificité enzymatique. Le design de modèles d'enzymes. Le rôle des ions métalliques. Modèles biomoléculaires des coenzymes et importance médicinale des substrats suicide.
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Bloc 70F Bio-informatique des systèmes Option - Maximum 6 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIM 6064C Approches des systèmes 2.0
Module C. Approches des systèmes. Approches des systèmes dans l'analyse de la signalisation cellulaire et la génétique moléculaire.
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GBM 6106 Méthodes des systèmes en physiologie 3.0 Cours de jour
Méthodes d'analyse des systèmes linéaires et non linéaires : rétroaction, fonction de transfert, réponse en fréquence, linéarisation, stabilité. Applications aux principaux systèmes physiologiques. Remarques: Cours donné à l'Université de Montréal. L'étudiant de l'École Polytechnique doit s'inscrire par Autorisation d'études hors établissement (entente CRÉPUQ).
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GBM 6118 Imagerie médicale 3.0 Cours de jour
Modèles de formation d'images établissant les liens physiques entre les caractéristiques des tissus et leur images observées par radiologie, médecine nucléaire, échographie, tomographie axiale, résonance magnétique nucléaire, les problèmes inverses. Remarques: Cours donné à l'Université de Montréal. L'étudiant de l'École Polytechnique doit s'inscrire par Autorisation d'études hors établissement (entente CRÉPUQ).
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Bloc 70G Cours complémentaires Option - Maximum 6 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BCM 6071 Signalisation et cycle cellulaire 2.0 Cours de jour
Cycle cellulaire chez la levure et les eucaryotes supérieurs. Apoptose et mort cellulaire. Signalisation et cycle cellulaire. Intégration des voies de signalisation. Interactions protéines-protéines dans la signalisation.
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BCM 6100 Biologie du développement 2.0 Cours de jour
Mécanismes moléculaires gouvernant le développement des eucaryotes supérieurs : détermination, établissement des axes embryonnaires, différenciation, contrôle de l'expression des gènes. Aspects moléculaires du développement du système nerveux.
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IFT 6150 Traitements d'images 4.0 Cours de jour Cours de soir
Échantillonnage. Opérations sur les images. Amélioration. Restauration. Compression. Réalisation d'un projet appliqué.
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IFT 6255 Recherche d'information 4.0 Cours de jour
Principe de la recherche d'information. Sélection des documents pertinents. Modèles booléen, vectoriel, probabiliste, logique. Réalisation. Évaluation des performances. Analyses linguistiques, syntaxiques et sémantiques.
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IFT 6281 Gestion de documents 4.0
Types de documents. Traitements de données textuelles : transformation, édition, compression, cryptage. Analyse syntaxique et compréhension de texte. Recherche documentaire. Indexation automatique. Hypertexte.
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IFT 6370 Informatique théorique 4.0 Cours de jour
Modèles du calcul. Calculabilité et décidabilité. Complexité. Hiérarchies. Complétudes. Sujets choisis.
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IFT 6575 Méthodes de recherche opérationnelle 4.0 Cours de jour
Programmation linéaire. Programmation en nombres entiers. Programmation non linéaire. Programmation dynamique. Modèles stochastiques. Simulation.
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IFT 6751 Métaheuristiques en optimisation 4.0
Principales métaheuristiques utilisées en optimisation : recherche tabou, recuit simulé, algorithmes évolutionnaires, colonies de fourmis, réseau de neurones. Approches hybrides et parallèles. Optimisation multicritère.
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Bloc 70H Choix - Maximum 4 crédits.

Bloc 70I Recherche et mémoire Obligatoire - 30 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIN 6008 Projet de recherche avec mémoire 30.0  

Segment 71 Propre au cheminement avec Stage

Les crédits du cheminement sont répartis de la façon suivante : 25 crédits de cours obligatoires dont 22 crédits attribués à des stages, de 16 à 20 crédits à option, dont au moins deux cours BIN, et de 0 à 4 crédits de cours au choix.

Bloc 71A Obligatoire - 3 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIE 6046 Introduction : éthique de la recherche 1.0
Les développements biomédicaux et l'éthique de la recherche; les grands textes régulateurs; l'analyse d'une problématique éthique; l'évaluation éthique d'un protocole de recherche.
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BIN 60051 Communication scientifique 1.1 0.0 Cours de jour
Présentation orale et écrite par l'étudiant de son projet de recherche ou de stage : la littérature scientifique pertinente, la problématique et les méthodes envisagées. Participation aux séminaires des autres étudiants.
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BIN 60052 Communication scientifique 1.2 2.0 Cours de jour
Présentation orale et écrite par l'étudiant de son projet de recherche ou de stage : la littérature scientifique pertinente, la problématique et les méthodes envisagées. Participation aux séminaires des autres étudiants.
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Bloc 71B Bio-informatique génomique Option - Maximum 12 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BCM 6210 Génomique humaine fonctionnelle 3.0 Cours de jour
Étude du fonctionnement du génome humain. Structure du génome et méthodes d'analyse fonctionnelle, grandes bases de données et outils bioinformatiques. Génomique comparative avec d'autres organismes séquencés. Protéomique et métabolomique.
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BIN 6000 Algorithmes en bio-informatique génomique 4.0 Cours de jour
Comparaison et alignement des séquences biologiques. Structures secondaires des acides ribonucléiques. Recherche de motifs. Assemblage de fragments d'ADN, cartographie physique. Ordre des gènes.
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BIN 6002 Principes d'analyse génomique 3.0
Identification (gènes protéiques et d'ARNs structuraux introns) par comparaison de séquences et recherche de motifs. Alignements multiples et code génétique. Assemblage et annotation de séquence génomique.
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IFT 6299 Sujets en bio-informatique 4.0 Cours de jour  
PGM 6078 Pharmacogénomique 3.0 Cours de jour
Présenter les différentes approches utilisées dans le diagnostic et le traitement de maladies basé sur l'information génomique, avec comme objectif de développer une pharmacothérapie personnalisée optimale.
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Bloc 71C Bio-informatique évolutive Option - Maximum 10 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIO 6245 Analyse phylogénétique 4.0
Théorie et pratique de la systématique : reconstruction, validation et utilisation de phylogénies en biographie, écologie, conservation, et classification. Cours théoriques et travaux pratiques sur ordinateurs.
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MSO 6018 Introduction à l'épidémiologie génétique 3.0 Cours de jour
Introduction à l'épidémiologie génétique et aux méthodes analytiques s'y reliant, appuyée d'exemples relevés de la littérature scientifique et de travaux pratiques portant sur analyses de liaison et d'association génétique.
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Bloc 71D Bio-informatique stat. et apprentissage de machine Option - Maximum 17 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIO 6077 Analyse quantitative des données 4.0 Cours de jour
Apprentissage de méthodes d'analyse quantitative de données biologiques, y compris les données spatiales et temporelles. Travaux pratiques; analyse des données de recherche des étudiants. Remarques: Connaissances requises : biostatistique.
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IFT 6390 Fondements de l'apprentissage machine 4.0 Cours de jour
Éléments de base des algorithmes d'apprentissage statistique et symbolique. Exemples d'applications en forage de données, reconnaissance des formes, régression non linéaire, et données temporelles.
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Bloc 71E Bio-informatique structurale Option - Maximum 16 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BCM 6200 Structure des macromolécules biologiques 3.0
Détermination de structures macromoléculaires par diffraction des rayons-X et par résonance magnétique nucléaire. Modélisation moléculaire. Remarques: Cours conjoint avec l'Université McGill (Biochem 507-604A). Cours offert aux deux ans.
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BIN 6001 Algorithmes en bio-informatique moléculaire 4.0 Cours de jour
Structure 3D des protéines et ARN. Modèles et optimisation de l'énergie potentielle, moléculaire. Espace et recherche de conformations, modélisation comparative et de novo.
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BIN 6003 Architecture des polymères biologiques 3.0 Cours de jour
Conformation macromoléculaire. Analyse de structures tridimensionnelles.
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CHM 6330 Chimie bio-organique 3.0
Importance de la chiralité dans la vie. Facteurs responsables de la spécificité enzymatique. Le design de modèles d'enzymes. Le rôle des ions métalliques. Modèles biomoléculaires des coenzymes et importance médicinale des substrats suicide.
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Bloc 71F Bio-informatique des systèmes Option - Maximum 6 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIM 6064C Approches des systèmes 2.0
Module C. Approches des systèmes. Approches des systèmes dans l'analyse de la signalisation cellulaire et la génétique moléculaire.
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GBM 6106 Méthodes des systèmes en physiologie 3.0 Cours de jour
Méthodes d'analyse des systèmes linéaires et non linéaires : rétroaction, fonction de transfert, réponse en fréquence, linéarisation, stabilité. Applications aux principaux systèmes physiologiques. Remarques: Cours donné à l'Université de Montréal. L'étudiant de l'École Polytechnique doit s'inscrire par Autorisation d'études hors établissement (entente CRÉPUQ).
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GBM 6118 Imagerie médicale 3.0 Cours de jour
Modèles de formation d'images établissant les liens physiques entre les caractéristiques des tissus et leur images observées par radiologie, médecine nucléaire, échographie, tomographie axiale, résonance magnétique nucléaire, les problèmes inverses. Remarques: Cours donné à l'Université de Montréal. L'étudiant de l'École Polytechnique doit s'inscrire par Autorisation d'études hors établissement (entente CRÉPUQ).
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Bloc 71G Cours complémentaires Option - Maximum 14 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BCM 6071 Signalisation et cycle cellulaire 2.0 Cours de jour
Cycle cellulaire chez la levure et les eucaryotes supérieurs. Apoptose et mort cellulaire. Signalisation et cycle cellulaire. Intégration des voies de signalisation. Interactions protéines-protéines dans la signalisation.
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BCM 6100 Biologie du développement 2.0 Cours de jour
Mécanismes moléculaires gouvernant le développement des eucaryotes supérieurs : détermination, établissement des axes embryonnaires, différenciation, contrôle de l'expression des gènes. Aspects moléculaires du développement du système nerveux.
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IFT 6150 Traitements d'images 4.0 Cours de jour Cours de soir
Échantillonnage. Opérations sur les images. Amélioration. Restauration. Compression. Réalisation d'un projet appliqué.
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IFT 6255 Recherche d'information 4.0 Cours de jour
Principe de la recherche d'information. Sélection des documents pertinents. Modèles booléen, vectoriel, probabiliste, logique. Réalisation. Évaluation des performances. Analyses linguistiques, syntaxiques et sémantiques.
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IFT 6281 Gestion de documents 4.0
Types de documents. Traitements de données textuelles : transformation, édition, compression, cryptage. Analyse syntaxique et compréhension de texte. Recherche documentaire. Indexation automatique. Hypertexte.
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IFT 6370 Informatique théorique 4.0 Cours de jour
Modèles du calcul. Calculabilité et décidabilité. Complexité. Hiérarchies. Complétudes. Sujets choisis.
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IFT 6575 Méthodes de recherche opérationnelle 4.0 Cours de jour
Programmation linéaire. Programmation en nombres entiers. Programmation non linéaire. Programmation dynamique. Modèles stochastiques. Simulation.
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IFT 6751 Métaheuristiques en optimisation 4.0
Principales métaheuristiques utilisées en optimisation : recherche tabou, recuit simulé, algorithmes évolutionnaires, colonies de fourmis, réseau de neurones. Approches hybrides et parallèles. Optimisation multicritère.
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Bloc 71H Choix - Maximum 4 crédits.

Bloc 71I Stage Obligatoire - 22 crédits.

Cours Titre Crédits Période  
BIN 6007 Stages avec rapport 22.0
Le stage sera effectué au sein d'une équipe de professionnels oeuvrant dans un laboratoire académique, hospitalier, gouvernemental ou en milieu industriel (ou dans tout autre milieu approuvé par le responsable) Remarques: L'étudiant participera à un projet de recherche où il mettra en application les notions et pratiques enseignées.
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Date de la dernière modification: 21 novembre 2017

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